中医药科学院成立于2024年11月，与科技创新中心合署办公，系湖南中医药大学直属科研（教学）机构，主要职能为科技服务、科学研究和实验教学等。
中医药科学院下设综合办公室、科教部、实验动物中心、公共实验技术中心以及18个研究所：中医基础研究所、中医诊断研究所、中药资源研究所、中药制剂关键技术研究所、针灸推拿研究所、中医药创新药物研究所、药食同源健康产品研究所、中医药精准医学研究所、中医药转化医学研究所、中西医结合（心脑血管）研究所、中医五官（眼科）研究所、中医肿瘤研究所、中医肝病研究所、中医外科（皮肤、肛肠）研究所、中医药生殖健康研究所、第一临床研究所、第二临床研究所、中医药文化传播和政策研究所。
部门网址：
中医药科学院（科技创新中心）：http://kczx.hnucm.edu.cn/
